Město Meziboří leží na svazích Krušných hor ve výšce 550 metrů nad mořem. Nejbližším městem je na jihovýchod město Litvínov, které je vzdáleno od Meziboří necelé 3 kilometry. Směrem na severozápad od Meziboří leží v protějších kopcích obec Klíny a její část osada Rašov. Některé domy z těchto obcí lze spatřit z horní části Meziboří. Pokud byste vyšli až na vrchol mezibořské sjezdovky, mohli byste z její druhé strany pozorovat celý lyžařský areál na Klínech. Jiné město či vesnice z Meziboří již vidět není, neboť je město obklopeno lesy a kopci.
Na severu se za městem zdvihají dva kopce. Ten menší, na kterém je postavěna telekomunikační věž se jmenuje Střelná a měří 868 m n. m., druhý kopec není z Meziboří viditelný, přestože je ještě vyšší! Jmenuje se Loučná a měří skoro 1000 metrů (956 m n.m.). V jižní části města je menší kopec, na kterém je umístěn radiový vysílač, tento kopec se jmenuje Markův kopec, přestože mu mnozí lidé z Meziboří přezdívají Palpost. Název Palpost dostal kopec odvozením od tzv. palebného postavení, kdy zde po 2.světové válce sídlili vojáci, kteří protiletadlovými děly zajišťovali bezpečnost chemických závodů (Chemopetrolu).
Město je z východu i západu ohraničeno dvěma údolími, v nichž protékají dva potoky. Na východě teče
Poustevnický potok do údolí Louček.
Po cestě musí překonat také vodárnu
*), která upravuje vodu z přehrady
Fláje, tuto vodu pijeme nejen
my, ale také obyvatelé okolních měst a obcí. Naše pitná voda zásobuje i město Teplice a částečně krajské město Ústí nad Labem. Podél tohoto potoka vede
naučná stezka až do Litvínova do části zvané Loučky
.
Na druhé straně Meziboří, tedy na západě, teče Bílý potok příkrým šumenským údolím ( Šumný důl, možno prohlédnout i video ) až do litvínovské části města nazvané podle tohoto
údolí Šumná. Třetí a poslední potok, který protéká přímo samotným Mezibořím se jmenuje
Divoký potok. Pramení nad městem v bukovém lese a teče podél
ulice nazvané Potoční až k základní škole v Meziboří, kde je jeho tok usměrněn do podzemního potrubí. Potrubím teče pod zbývající částí města až do
Mezibořského údolí, kde opět vytéká a teče až do Litvínova. Mezibořské údolí je pro město velice důležité, neboť spojuje město Meziboří s městem
Litvínov a vede tudy hlavní silnice, po které jezdí automobily a městská hromadná doprava. Všechny tři potoky patří do povodí Ohře.
*) voda z Poustevnického potoka není zdrojem pitné vody !